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  human microarray for gene expression   小鼠表达谱芯片 v2 保留 v1 中专一性佳的 MEEBO 探针, 并依据 RefSeq 42Ensembl 59 资料库进行探针的更新, 提供更高基因覆盖率的表达谱芯片。探针设计采用 “一个基因,一个探针” 的设计原理, 以 IMPORT 专利技术针对蛋白质编码基因设计高专一性探针, 并以自主的高速布放技术进行芯片生产。
 
 

 
 
    阴性控制探针  
 
  芯片实验的设计上,常需要利用阴性探针 (Negative Control) 的设计来监测或确认实验的流程。 因此,在 OneArray® 芯片的针设计上,加入 ArrayControl™ RNA SPIKE 探针组及外部品质控制探针组 (ETQC), 此两组探针与目标基因皆不会产生杂交的反应,可规划作为监控实验流程的外源性探针。
 
 
 
  . ArrayControl™ RNA SPIKE  
  ArrayControl™ RNA SPIKE 探针组经由 Ambion 公司授权, 可使用于 OneArray® 芯片产品上。 以 Mouse reference RNA (sample A) and Mouse brain RNA (sample B) 为样品进行测试, 当实验过程中没有外加经萤光标记的 ArrayControl™ RNA SPIKE 的目标序列时, 芯片杂交后的实验结果显示, ArrayControl™ RNA SPIKE 探针组的讯号会趋近于背景值, 显示这些探针不会与小鼠目标基因发生杂交的现象,可作为阴性控制探针使用。 此结果也同时验证 ArrayControl™ RNA SPIKE 探针组序列的外源性, 可以用来当做监控实验流程的外源性控制探针。
 
 
 
代号 Ambion 代号 Sample A Sample B 阴性控制探针 外源性控制探针
AM_c_0000015 Array Control RNA SPIKE 1 117.1 123.7   V
AM_c_0000016 Array Control RNA SPIKE 2 165.0 141.7   V
AM_c_0000017 Array Control RNA SPIKE 3 121.9 131.8   V
AM_c_0000018 Array Control RNA SPIKE 4 64.0 142.5   V
AM_c_0000019 Array Control RNA SPIKE 5 227.5 134.0   V
AM_c_0000020 Array Control RNA SPIKE 6 119.9 80.0   V
AM_c_0000021 Array Control RNA SPIKE 7 99.4 90.5 V V
AM_c_0000022 Array Control RNA SPIKE 8 59.6 49.5 V V

   
     
    . 外部品质控制探针组 (ETQC)
    ETQC 探针组为一组特别设计的外源性探针, 可用来监测芯片的杂交品质,使用于 OneArray® 芯片产品上。 以 Mouse reference RNA (sample A) 与 Mouse brain RNA (sample B) 为样品进行测试, 当实验过程中没有外加经萤光标记的的 ETQC 的目标序列时, 芯片杂交后的实验结果显示,ETQC 探针组的讯号会趋近于背景值, 显示这些探针不会与小鼠目标基因发生杂交的现象,可作为阴性控制探针使用。 此结果也同时验证 ETQC 探针组序列的外源性,可以用来当做监控实验流程的外源性控制探针。
 
   
代号 参考资料 Sample A Sample B 阴性控制探针 外源性控制探针
PH_c_0000066 NM_202341.1
(Entrez Gene ID: 842522)
35.7 36.5 V V
PH_c_0000067 NM_122927.2
(Entrez Gene ID: 833497)
38.3 60.0 V V
PH_c_0000068 NM_001036207.1
(Entrez Gene ID: 843854)
40.3 51.8 V V
PH_c_0000069 NM_104167.4
(Entrez Gene ID: 841722)
39.0 39.8 V V
PH_c_0000070 NM_129890.3
(Entrez Gene ID: 818930)
41.3 41.3 V V
PH_c_0000071 NM_106286.3
(Entrez Gene ID: 843969)
39.7 40.7 V V