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定位标记控制探针 |
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定位标记控制探针主要是用来辅助芯片及扫描的定位,依功能不同,
又可归类为三种,包含定向校准标记 (OGAM, Orientation Grid Alignment Mark)、
角点校准标记 (CGAM, Corner Grid Alignment Mark) 及矩阵校准标记 (GAM, Grid Alignment Mark)。
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中文名称 |
代号 |
探针编号 |
设计目的 |
说明 |
定向校准标记 |
OGAM |
PH_c_0000089 |
确认芯片扫描方向 |
OGAM 是带有 Cy3/Cy5 标记的 60 bp 序列,位于芯片顶端左上角的的起始标记区域,使用不同的扫描器可能会有不同的定位输出格式。 |
角点校准标记 |
CGAM |
PH_c_0000072 |
辅助扫描作为角点 |
CGAMs 是带有 Cy3/Cy5 标记的 60 bp 序列,位于芯片阵列的四个角落,可作为自动或手动对齐分析影像的基准;可兼用于 Cy3 (532 nm) 或 Cy5 (635 nm) 的扫描讯号。 |
矩阵校准标记 |
GAM |
PH_c_0000001 |
辅助扫描器及探针定位 |
GAM 是带有 Cy3 标记的 60 bp 序列,共有 90 个以上的 GAM 标记均匀的分布在整个芯片的矩阵范围内,这些探针无需经过杂交反应就可以产生 532 nm 的激发光,可作为定向或矩阵范围标记。 |
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小鼠表达谱芯片 OGAM 与 CGAM 位置示意图。 |

小鼠表达谱芯片 GAM 位置示意图。 |
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