产品资讯 > 小鼠表达谱芯片 Mouse OneArray® v2 > 产品功效 \ 探究能力

 
  human microarray for gene expression   小鼠表达谱芯片 v2 保留 v1 中专一性佳的 MEEBO 探针, 并依据 RefSeq 42Ensembl 59 资料库进行探针的更新, 提供更高基因覆盖率的表达谱芯片。探针设计采用 “一个基因,一个探针” 的设计原理, 以 IMPORT 专利技术针对蛋白质编码基因设计高专一性探针, 并以自主的高速布放技术进行芯片生产。
 
 

 
 
  小鼠表达谱芯片 v2 的探针设计, 是华联技术团队保留 v1 中专一性佳的 MEEBO 探针并参考国际公认之 RefSeqEnsembl 序列资料库, 藉由经年累积的经验所研发之基因注解运算流程,设计具高度专一性的长链 60 个碱基寡核酸 (sense-strand) 的基因探针, 内容以蛋白质编码基因 (protein-coding gene) 为主, 提供高基因覆盖率及涵盖完整生理途径反应相关基因之研究利器。
 
 
  基因注解流程  
  为更完备的设计一组符合使用者需求的基因探针,华联技术团队以既有的专利技术及研发经验, 发展出一套特殊的探针注解流程。藉由此流程的分析结果得知,增加探针密度与数量并不与增加基因覆盖率及探究能力成正比, 因此小鼠表达谱芯片的探针设计是以 “一个基因,一个探针” 为设计的理念, 设计一组微阵列专用的探针组。
 
 
   
 
  高基因覆盖率  
 
  探针注解分析流程,可利用不同的资料库进行探针的注解。 华联生技以 RefSeq 资料库进行序列的比对, 挑选仅对应到一个基因的 exon 或是 3’ UTR 区域的探针, 利用这些探针进行芯片基因覆盖率分析;资料显示不同产品可涵盖的蛋白质编码基因 (Protein-coding gene) 数约 18,000 (右下图绿色的部分), 分析结果显示 OneArray® 小鼠表达谱芯片探针数目虽不及其他产品, 不过与其它平台一样具高度的基因覆盖率。  
 
   
  <<按此图片放大>>  
 
  高基因探针专一性  
 
  为增加芯片结果的正确性, OneArray® 小鼠表达谱芯片 v2 利用 IMPORT 专利技术设计 60 个碱基寡核酸的长链探针, 经计算及比对后,结果显示有 99.5% 的探针, 对单一基因有 85% 以上的相似度 (identification) ,但对于其他基因相似度小于 76% ,具有高度辩识的专一性。  
 
   
  <<按此图片放大>>