小鼠表达谱芯片 (MOA) 产品功效


			小鼠表达谱芯片 v2 保留 v1 中专一性佳的 MEEBO 探针，并依据 RefSeq 42 及 Ensembl 59 资料库进行探针的更新，提供更高基因覆盖率的表达谱芯片。探针设计采用 “一个基因，一个探针” 的设计原理，以 IMPORT 专利技术针对蛋白质编码基因设计高专一性探针，并以自主的高速布放技术进行芯片生产。

	小鼠表达谱芯片 v2 的探针设计，是华联技术团队保留 v1 中专一性佳的 MEEBO 探针并参考国际公认之 RefSeq 及 Ensembl 序列资料库，藉由经年累积的经验所研发之基因注解运算流程，设计具高度专一性的长链 60 个碱基寡核酸 (sense-strand) 的基因探针，内容以蛋白质编码基因 (protein-coding gene) 为主，提供高基因覆盖率及涵盖完整生理途径反应相关基因之研究利器。

	基因注解流程

	为更完备的设计一组符合使用者需求的基因探针，华联技术团队以既有的专利技术及研发经验，发展出一套特殊的探针注解流程。藉由此流程的分析结果得知，增加探针密度与数量并不与增加基因覆盖率及探究能力成正比，因此小鼠表达谱芯片的探针设计是以 “一个基因，一个探针” 为设计的理念，设计一组微阵列专用的探针组。


	高基因覆盖率

	探针注解分析流程，可利用不同的资料库进行探针的注解。华联生技以 RefSeq 资料库进行序列的比对，挑选仅对应到一个基因的 exon 或是 3’ UTR 区域的探针，利用这些探针进行芯片基因覆盖率分析；资料显示不同产品可涵盖的蛋白质编码基因 (Protein-coding gene) 数约 18,000 (右下图绿色的部分)，分析结果显示 OneArray^® 小鼠表达谱芯片探针数目虽不及其他产品，不过与其它平台一样具高度的基因覆盖率。


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	高基因探针专一性

	为增加芯片结果的正确性， OneArray^® 小鼠表达谱芯片 v2 利用 IMPORT 专利技术设计 60 个碱基寡核酸的长链探针，经计算及比对后，结果显示有 99.5% 的探针，对单一基因有 85% 以上的相似度 (identification) ，但对于其他基因相似度小于 76% ，具有高度辩识的专一性。


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