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  human microarray for gene expression   小鼠表达谱芯片 v2 保留 v1 中专一性佳的 MEEBO 探针, 并依据 RefSeq 42Ensembl 59 资料库进行探针的更新, 提供更高基因覆盖率的表达谱芯片。探针设计采用 “一个基因,一个探针” 的设计原理, 以 IMPORT 专利技术针对蛋白质编码基因设计高专一性探针, 并以自主的高速布放技术进行芯片生产。
 
 

 
 
    内部品质控制探针  
 
  为了监测样品备制备过程中 RNA 放大的效率、样品 RNA 的完整性及杂交效率等, 在每一芯片上设计有三组内部品质控制探针,分别为内部杂交对照探针 (IHC, Intrinsic Hybridization Control) 、 内部杂交对照梯度讯号探针 (IHL, Intrinsic Hybridization Ladder)、 内部目标品质对照 (ITQC, Intrinsic Target Quality control)
 
 
 
中文名称 代号 探针编号 设计目的 说明
内部杂交对照探针 IHC PH_c_0000100 监测样品备制与杂交效率 IHC 是包含了11housekeeping gene 的混合探针,可作为阳性控制探针,平均分布在整个芯片阵列,共有超过 95 个重复。
内部杂交对照梯度讯号探针 IHL PH_c_0000101 ~ PH_c_0000116 监测样品备制与杂交效率 IHL 是来自于 IHC 的连续稀释。经过杂交,IHL 的数据可反应出浓度与讯号强度的趋势线,作为样品备制与杂交反应的整体效能指标。
内部目标品质对照探针 ITQC PH_mc_0000001 ~ PH_mc_0000014 监测样品 RNA 长度以评估完整性与放大处理过程 包含 5 个内参照基因,每个基因于自 3’ 端起算的 300~600 bp、900~1200 bp 各设计 1 个探针。
 
  . 内部杂交对照梯度讯号探针 (IHC / IHL)  
 
参照 OneArray® 使用说明设定扫描器后,IHC 讯号值会到达饱和或趋近饱和 (~60,000)。此时,IHL 的讯号值由低浓度到高浓度会呈现线性递增的现象。  
  . 内部目标品值对照探针 (ITQC)  
 
代号 基因名称 300-600 nt 900-1200 nt
ITQC_1 TATA box binding protein (Tbp) PH_mC_0000001 PH_mC_0000002
ITQC_2 transferrin receptor (Tfrc) PH_mC_0000003 PH_mC_0000004
ITQC_4 ribophorin II (Rpn2) PH_mC_0000007 PH_mC_0000008
ITQC_6 cathepsin D (Ctsd) PH_mC_0000011 PH_mC_0000012
ITQC_7 vimentin (Vim) PH_mC_0000013 PH_mC_0000014

 
 
   
  在实验流程及放大效率良好的情况下,所有的 ITQC 探针都可以测得讯号, 而且越靠近 3’ 端的探针会有较高的萤光讯号值, 上图为 ITQC 探针测试的结果。