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  Yeast microarray for gene expression   酵母菌表达谱芯片 v1 的探针是采用 Operon Yeast Genome Array-Ready Oligo Set (AROS) v1.1Yeast Brown Lab Oligo Extension (YBOX) v1.0 探针组资讯所设计, 为长链 70 个碱基寡核酸探针。 酵母菌表达谱芯片 v120103 月上市。 探针皆设计在离 3’750 碱基以内的序列,适合用来进行基因表现的研究。

 
 
  
扫描强度参考探针
 
扫描强度参考探针是两组具有浓度梯度特性的探针, 主要的功能是利用探针浓度与讯号萤光强度相对应的关系,用来调整扫描器的条件设定。 此两组探针分别以 Cy3Cy5 进行预标记, 不需要经过杂交反应就可以产生 532 nm (Cy3)635 nm (Cy5) 的激发, 每一组个包含 8 个浓度梯度,每一浓度的代表探针有 3~6 重复。
 
   
中文名称 代号 探针编号 设计目的 说明
扫描强度参考探针 Cy3 PH_c_0000002
~
PH_c_0000009
辅助扫描器设定向 参照 OneArray® 使用说明设定扫描器,PH_c_0000008PH_c_0000016 的讯号应该是饱和或接近饱和。扫描器的设定应使各组讯号由低浓度呈线性递增至饱和。

Cy5 PH_c_0000010
~
PH_c_0000017
 
   
Cy3 Cy5 探针浓度
PH_c_0000002 PH_c_0000010 0.39
PH_c_0000003 PH_c_0000011 0.78
PH_c_0000004 PH_c_0000012 1.56
PH_c_0000005 PH_c_0000013 3.125
PH_c_0000006 PH_c_0000014 6.25
PH_c_0000007 PH_c_0000015 12.50
PH_c_0000008 PH_c_0000016 25.00
PH_c_0000009 PH_c_0000017 50.00
    上方为扫描强度参考探针的浓度列表,包含 PH_c_0000002PH_c_0000009Cy3 标记探针及 PH_c_0000010PH_c_0000017Cy5 标记探针两组。
 
   
Probe ID F635
Median
F635
Mean
PH_c_0000010 10891 10055
PH_c_0000011 21901 20505
PH_c_0000012 40350 35740
PH_c_0000013 62227 48734
PH_c_0000014 65535 56401
PH_c_0000015 65535 60702
PH_c_0000016 65535 60084
PH_c_0000017 65535 61668
    上方图表为 Cy5 标定的扫描强度参考探针组 (PH_c_0000010PH_c_0000017) 的测试结果。 经由扫描器的调整,PH_c_0000017 探针的讯号接近饱和 (~ 60,000),且各浓度与讯号间呈现正相关。